Verner Thomé var framför allt impressionist, men prövade sig också på pointillism och var en av de första konstnärer som tillägnade sig den så kallade rena palettens färgvärld. Han föddes i Finland och studerade vid Helsinki University Art School och Finnish League of Artists. Han är känd för uttrycksfulla landskap och fint tecknade porträtt.
Som landskapsmålare intresserade Verner Thomé inte för konstteori, viktigare var den direkta visuella kontakten med motivet. Han tog privatlektioner för Eero Järnefelt, men den främsta av hans lärare var Helene Schjerfbeck på Finska konstföreningens ritskola. Hon uppmanade Thomé, som då redan hade utvecklats långt som tecknare och målare, att helt och hållet ägna sig åt att vara fri konstnär.
Sin första studieresa styrde Verner Thomé inte till Paris, som de flesta andra vid denna tid, utan till München och den kungliga konstakademin i Bayern. Där studerade han 1901–1902 framförallt djurmåleri under sakkunnig ledning av professor Heinrich von Zügel. Den goda grundutbildningen ställde Thomé i nästintill samma position som de äldre mästarna. Kontakten med Magnus Enckell i Paris innebar en avgörande förnyelse i hans konstnärliga utveckling.
Han anses vara en av de främsta finländska representanterna för moderna strävanden i måleriet. Nationalgalleriet Ateneum i Helsingfors äger flera verk av Verner Thomé, bland annat I Borélys park (Marseille) som visar ett färggrant landskap i flödande och bländande sol. Den ställdes ut, jämte Vår i Parc Monceau och flera solstudier i akvarell, på den uppmärksammade Baltiska utställningen i Malmö 1914 och i Stockholm 1916.
Verner Thomé hyllades av kritikerna för sina utställningar och var efter 1912 en självskriven medlem av Septemgruppen, som han grundade ihop med Magnus Enckell och där Ellen Thesleff var en av medlemmarna. Gruppens medlemmar tog avstånd från tidens mörkstämda nationella måleri och fick en banbrytande betydelse för den finländska konsten.
Verner Thomé var ständig ledamot av Finlands konstakademi, och ordinarie medlem av Salon d’automne i Paris. Åren 1937–1944 var han också medlem av direktionen för Helsingfors konsthall.
Representerad på flera viktiga finländska muséer, bland annat med ett stort antal verk på Ateneum i Helsingfors och på NationaLmuseum i Stockholm. Han utförde också ett stort verk beställt av Helsingfors Centralstation.